Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms