Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nkiras1Q8CEC5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms