Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms