Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ephb1Q8CBF3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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