Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxo48Q8CAT8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms