Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc142Q8CAI1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms