Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Atg4aQ8C9S8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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