Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc159Q8C963 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc159Q8C963 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms