Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp20Q8C6M1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp20Q8C6M1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp20Q8C6M1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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