Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ccdc113Q8C5T8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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