Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tnfsfm13Q8BXS2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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