Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Trerf1Q8BXJ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Trerf1Q8BXJ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trerf1Q8BXJ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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