Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3dQ8BX13 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3dQ8BX13 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ube3dQ8BX13 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ube3dQ8BX13 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ube3dQ8BX13 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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