Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BPC6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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