Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms