Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms