Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo4Q8BJ73 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo4Q8BJ73 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms