Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup93Q8BJ71 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup93Q8BJ71 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms