Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl1Q8BH66 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl1Q8BH66 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms