Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms