Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms