Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms