Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx32Q80ZJ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms