Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Amigo1Q80ZD8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Amigo1Q80ZD8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Amigo1Q80ZD8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms