Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnnQ80Z71 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnnQ80Z71 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms