Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms