Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ttc28Q80XJ3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttc28Q80XJ3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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