Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrde2Q80XC6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms