Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms