Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfap100Q80VN0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap100Q80VN0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap100Q80VN0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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