Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll4Q80UG8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll4Q80UG8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms