Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NischQ80TM9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
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