Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2q1Q7TSS2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Ube2q1Q7TSS2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Ube2q1Q7TSS2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Ube2q1Q7TSS2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Ube2q1Q7TSS2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms