Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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