Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms