Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms