Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms