Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms