Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms