Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMA4

Ffar4, Free fatty acid receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ffar4Q7TMA4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ffar4Q7TMA4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ffar4Q7TMA4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ffar4Q7TMA4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ffar4Q7TMA4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ffar4Q7TMA4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms