Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms