Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms