Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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