Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms