Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih3Q6ZWS4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms