Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms