Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ino80Q6ZPV2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80Q6ZPV2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms