Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn5Q6VZZ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms