Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms