Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.9 ms